Zoteroではエントリまたはカテゴリを削除しても，その添付ファイル（PDF：リンクされた添付ファイルを含む）は削除されません．
したがってエントリの追加と削除を繰り返すと無駄なPDFファイルがどんどん溜まっていくことになってしまいます．
これを解決するプラグインがあります．
Delete item(s) with attachment(s)
そのものズバリですが，ダウンロードはこちらから．中国語なので翻訳ツールを使用して読みましょう．githubなのでReleasesから最新版のxpiファイルをダウンロードできるはずです．
使い方
例によってメニューバーのツールからプラグインを選択してプラグイン画面を開き，右上の歯車から「ファイルからインストール」を選択して先程の.xpiファイルを開いてインストール．
するとエントリを右クリックした際にメニューが追加されます．
エントリに加えて添付ファイルも削除したい際にはこれらのメニューを利用しましょう．
以上
引用
GitHub - redleafnew/delitemwithatt: Remove attachment(s) when delete the item(s) or collection in Zotero and JurisM.
Remove attachment(s) when delete the item(s) or collection in Zotero and JurisM. - redleafnew/delitemwithatt
github.com
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